力学生物学中切换行为的几何特征
摘要：力学生物学过程中涉及的蛋白质已经进化出专门和令人惊讶的对应应力的反应。表现出捕捉-滑动开关和力引发的途径开关的生化转化在细胞粘附、力感知和信号传导以及蛋白质折叠中起着重要作用。我们表明，这些开关行为是由描述受力诱导的结合态和过渡态变形的流场中的奇点所产生的。这些奇点允许完整表征二维（2D）自由能景观中的开关机制，并为阐明更高维模型中的新形式的开关提供了路径。值得注意的是，生成捕捉-滑动开关的奇点几乎出现在每个2D自由能景观中，这表明几乎任何满足2D模型的键在适当的力下都会表现出捕捉-滑动行为。我们将我们的分析应用于P-选择素和抗原提取的模型，以说明这些奇点如何提供直观框架来解释已知的行为并预测新的行为。
作者：Casey O. Barkan and Robijn F. Bruinsma
论文ID：2209.03324
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2023-07-19