Vimentin有丝分裂纺锤体形成模型
摘要：中间丝蛋白形成了一个重要的结构网络，在细胞质中广泛存在，并在细胞力学、细胞内组织和分子信号传导中起着关键作用。网络的维护和适应细胞的动态行为依赖于几个涉及细胞骨架相互作用的机制，这些机制尚未完全理解。数学建模允许我们比较几种生物学上合理的情景，以帮助解释实验数据。在这项研究中，我们观察和模拟了单个胶质细胞中间丝蛋白在圆形微图案上的动态行为，在微管受到均环酮处理后。在这些条件下，中间丝蛋白丝会向细胞中心移动并在最终达到稳态之前积累。在没有微管驱动运输的情况下，中间丝蛋白网络的运动主要由肌动蛋白相关机制驱动。为了模拟这些实验结果，我们假设中间丝蛋白可能存在两种状态，即可移动和不可移动，并在未知的速率（无论是恒定还是非恒定）之间切换。假设可移动的中间丝蛋白以恒定或非恒定速度运动。我们使用这组假设引入了几种生物学上合理的情景。对于每个情景，我们使用微分进化来找到产生与实验数据最接近的解的最佳参数集，然后使用阿卡伊克信息准则来评估这些假设。这种建模方法使我们能够得出结论，即我们的实验数据最好能够通过空间相关的中间丝蛋白阻塞或空间相关的肌动蛋白依赖运输速度来解释。
作者：Youngmin Park, C''ecile Leduc, Sandrine Etienne-Manneville, St''ephanie Portet
论文ID：2209.02780
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2023-06-14