准确定向5' -> 3'的Watson-Crick自动机
摘要:WK有限自动机在一根双链DNA分子上工作,该分子包含两条链,每条链都有一个5'和一个3'末端,这两条链共同构成具有以下特性的分子。这些链具有相同的长度,它们的5'到3'方向相反,并且在每个位置上,两条链的核苷酸互补(通过Watson - Crick互补关系)。因此,WK自动机有两个读头,一个用于每条链。在传统的WK自动机中,两个读头以相同的物理方向读取整个输入,但在5'->3' WK自动机中,读头从两个极端开始,并以相反的方向读取输入。在感知5'->3' WK自动机中,当读头相遇时,输入的过程完成,该模型能接受线性上下文无关语言的类别。确定性变种较弱,接受它们的类别被称为2detLIN,是线性语言的一个适当子类。最近,研究了另一种特定的变体,即状态确定性感知5'->3' WK自动机,其中自动机的图具有特殊属性,即对于图的每个节点,所有的出边(如果有的话)都指向一个唯一的节点,即每个状态有(最多)一个可以通过直接转换达到的状态。研究表明,在感知5'->3' WK自动机的情况下,这个概念在一定程度上与通常的确定性概念相互独立。本文研究了一个新的概念,即准确定性,即在每个计算的配置中(如果计算尚未完成),下一个状态是唯一确定的,尽管下一个配置可能不是,如果多个转换同时可用。我们证明了这个新概念是通常确定性和状态确定性的共同概括,即准确定性感知5'->3' WK自动机的类别是上述其他类别的超类。WK自动机有各种常见的限制,例如无状态或1-有限变体。我们还证明了由准确定性感知5'->3' WK自动机的各个子类接受的语言类别之间的一些层次关系,以及其他已知的语言类别。
作者:Benedek Nagy (Eastern Mediterranean University)
论文ID:2208.14730
分类:Formal Languages and Automata Theory
分类简称:cs.FL
提交时间:2022-09-01