单细胞分辨率下免疫调节药物反应的治疗代数
摘要：药物对人类免疫系统多样化细胞类型的影响尚未在转录组水平上得到很好的理解。本研究应用单细胞mRNA测序技术，分析502种免疫调节药物在单独使用和组合使用时对人类免疫细胞的反应。我们开发了一个统一的数学模型，通过单个推导的调控网络定量地描述了粒细胞和淋巴细胞类型对单个药物和药物组合的转录组反应。数学模型揭示了药物组合通过加性和非加性的药物相互作用，通过招募基因表达程序的组合来生成新的巨噬细胞和T细胞状态。简化的药物反应代数使我们能够预测通过组合药物剂量滴定对免疫细胞种群在激活、休息和高度抑制状态之间的持续调节。我们的结果表明，在转录组尺度的数学模型可以通过使用治疗药物的组合来设计治疗策略，以编程人类免疫系统。
作者：Jialong Jiang, Sisi Chen, Tiffany Tsou, Christopher S. McGinnis, Tahmineh Khazaei, Qin Zhu, Jong H. Park, Paul Rivaud, Inna-Marie Strazhnik, Eric D. Chow, David A. Sivak, Zev J. Gartner, Matt Thomson
论文ID：2208.10661
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2022-08-24