通过遗传变化来研究HIV与免疫系统之间的相互作用
摘要：人类免疫缺陷病毒（HIV）的慢性感染引发了一种非常复杂的共同进化过程，病毒试图逃避不断适应的宿主免疫系统。对这个过程的定量细节尚不清楚，但可以帮助疾病治疗和疫苗开发。在这里，我们研究了十个HIV感染者的纵向数据集，同时对B细胞受体和病毒进行深度测序。我们关注衡量病毒株和免疫库在时间点之间变化程度的简单参数。在单个患者的水平上，病毒宿主周转速率没有显示出任何显著的相关性，但如果跨患者聚合信息，它们就会相关。特别地，我们发现一种反相关关系：病毒群落组成的巨大变化伴随着B细胞受体库的小变化。这个结果似乎与天生的期望相矛盾，即当病毒快速突变时，免疫库需要改变以保持适应。然而，我们展示了观察到的反相关关系自然地出现，并可以用简单的种群遗传模型来理解。
作者：Andrea Mazzolini, Thierry Mora, Aleksandra M Walczak
论文ID：2207.12827
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2022-07-27