分子性质景观的粗糙度及其对可建模性的影响

摘要:分子发现和药物设计中,结构性质关系和活性景观常常被 qualitatively or quantitatively 分析,以指导化学空间的导航。这些分子属性景观的粗糙度(或平滑度)是它们最受关注的几何属性之一,因为它可以表征活性悬崖的存在,一般来说,越粗糙的景观往往意味着更具挑战性的优化问题。在这里,我们引入了一种用于描述分子属性景观粗糙度的一般性、量化的测量方法。所提出的粗糙度指数(ROGI)受到分形维度概念的松散启发,并与机器学习模型在众多回归任务上的 out-of-sample error 明显相关。

作者:Matteo Aldeghi, David E. Graff, Nathan Frey, Joseph A. Morrone, Edward O. Pyzer-Knapp, Kirk E. Jordan, Connor W. Coley

论文ID:2207.09250

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2022-10-13

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