SHREC 2022: 蛋白质-配体结合位点识别
摘要：SHREC 2022竞赛中参与蛋白质-配体结合位点识别的方法。蛋白质-配体结合区域的预测是计算生物物理学和结构生物学中一个活跃的研究领域，并且对于分子对接和药物设计具有重要作用。该竞赛的目标是评估计算方法在基于几何结构识别蛋白质中配体结合位点的效果。根据两个评估分数分析分割算法的性能，这些分数描述了一个假设的口袋与配体接触和确定正确的结合区域的能力。尽管某些方法表现出色，但我们展示了简单的非机器学习方法仍然与数据驱动的算法竞争力强劲。总体而言，口袋检测任务仍然是一个具有挑战性的学习问题，受到负样本不足的固有困难（数据不平衡问题）的影响。
作者：Luca Gagliardi, Andrea Raffo, Ulderico Fugacci, Silvia Biasotti, Walter Rocchia, Hao Huang, Boulbaba Ben Amor, Yi Fang, Yuanyuan Zhang, Xiao Wang, Charles Christoffer, Daisuke Kihara, Apostolos Axenopoulos, Stelios Mylonas, Petros Daras
论文ID：2206.06035
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2023-08-10