多尺度生物膜的计算建模
摘要：生物膜和细菌细胞的计算模型综述：作为工程活体材料的潜力 生物膜是一种普遍存在的生物材料，具有多种性质，有望成为工程活体材料（ELM）。本综述从分子尺度开始，自下而上地介绍了生物膜和细菌细胞的计算模型，涵盖了从中间尺度到连续尺度的方法，重点关注了剪切颗粒动力学（DPD）和个体为基础建模（IbM）等中等尺度算法。我们通过一些代表性研究作品来介绍不同尺度上的建模方法。通过现有研究工作，详细阐述了各个尺度上每种算法的优势和局限性。尤其是针对IbM，也称离散元方法（DEM），其准确描述了生物和机械特性的潜力。
作者：Hanfeng Zhai
论文ID：2206.03895
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2022-06-09