谷氨酰胺合成酶(GS)结构与功能的生物信息学分析
摘要:通过生物信息学技术预测Pseudoalteromonas sp.中谷氨酰胺合成酶(GS)的结构和功能,并为进一步研究提供理论基础。通过ORF finder获得Pseudoalteromonas sp.中GS序列的开放阅读框,并将其转化为氨基酸残基。通过Blast分析结构域。通过Protparam、ProtScale、SignalP-4.0、TMHMM、SOPMA、SWISS-MODEL、NCBI SMART-BLAST和MAGA 7.0等分析工具,预测和分析蛋白质的结构和功能。结果显示,该序列是由468个氨基酸残基组成的GS,理论分子量为51986.64 Da。该蛋白与Shewanella oneidensis的进化关系最近。它没有信号肽位点和跨膜域。GS的二级结构包含35.04%的α-螺旋,16.67%的扩展链,5.34%的β-转角和42.95%的随机卷曲。结论:该GU是一种具有多种生物学功能的蛋白质,可能被用作极端环境中微生物氮代谢的分子样品。
作者:Jiahao Ma, Guotong Xu, Le Ao, Siqi Chen, Jingze Liu
论文ID:2204.11026
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2022-04-26