用三维模板捕捉酶的几何、功能和演化
摘要：蛋白质功能位点的三维签名称为结构模板，例如配体结合腔、金属配位模体或催化位点。本研究探讨生成模板库和查询结构中保守的三维模体的算法。讨论了模板的应用以及在酶中研究进化联系的一些示例案例。我们还引入了使用多个模板来表示灵活位点的概念，作为通过酶结构中捕获的快照更好地理解催化的方法。从结构中的功能注释是一个重要的话题，最近由于新的更准确的蛋白质结构预测方法而重新引起了关注。因此，我们预计基于模板的功能位点检测将成为表征大量新的蛋白质模型的有力工具。
作者：Ioannis G. Riziotis and Janet M. Thornton
论文ID：2203.02687
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2022-03-08