N-甲基-D-天冬酰胺受体的甘氨酸结合区至少有三个氙结合位点
摘要：氙气可以产生全身麻醉，其主要靶蛋白是N-甲基-D-天门冬氨酸受体，它是离子通道，在中枢神经系统的功能中起着重要作用。氙气产生这种特定效果的分子机制仍然不清楚，可能是因为缺乏原子级结构数据。本研究通过五个独立的分子动力学模拟，发现了三个不同的结合位点，这些位点位于N-甲基-D-天门冬氨酸受体的甘氨酸结合区。氙气在这些位点的绝对结合自由能范围在-8到-14 kJ/mol之间。然而，这依赖于所选择的蛋白质构象进行计算，如果考虑其他构象，可能会得到更大的值。这三个位点彼此相邻，其中一个位于甘氨酸位点旁边。这可能解释了为什么F758W和F758Y突变可以防止氙气的竞争性抑制，而不影响甘氨酸结合。
作者：Yves-Henri Sanejouand
论文ID：2203.02219
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2022-05-13