互动性：虚拟现实技术与药物研发流程之间的缺失链接
摘要：虚拟现实在药物设计与开发中的潜力多年来一直得到认可。硬件和软件的发展现在意味着这一潜力开始得到实现，并且虚拟现实方法正在积极应用于这个领域。最新的进展是利用虚拟现实不仅可视化和与分子结构进行交互，还可与“实时”分子动力学模拟进行交互（虚拟现实交互分子动力学，iMD-VR），这不仅对灵活对接有用，还用于检查结合过程和构象变化。iMD-VR已被证明对创建与靶蛋白结合的配体复合物非常有用，例如最近应用于SARS-CoV-2主蛋白酶的肽抑制剂。在本综述中，我们使用术语“交互虚拟现实”来指代交互性是用户虚拟现实体验的固有部分的软件，例如在进行结构修改或与物理严谨的分子动力学（MD）模拟交互时，而不仅仅是使用虚拟现实控制器旋转和平移分子以增强可视化效果。在这里，我们描述了这些方法及其在与药物发现相关的问题上的应用，突出了它们在这个领域中提供的可能性。我们认为便于查看和操作分子结构和动力学，并能够实时修改结构（例如添加或删除原子）使现代交互虚拟现实成为药物开发方法中宝贵的工具。
作者：Rebecca K. Walters (1), Ella M. Gale (1), Jonathan Barnoud (1), David R. Glowacki (2) and Adrian J. Mulholland (1)
论文ID：2202.03953
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2022-02-09