SARS-CoV-2 Omicron变种的计算分析：宿主-病原体相互作用、致病性和可能的治疗方法洞察
摘要：Omicron变异株与先前两波疫情的回复努力相比，在COVID-19病例激增中负有重要责任，进一步威胁了传统的治疗方法。Omicron是引起关注的第五个变异株(VOC)，它在刺突蛋白的受体结合区域(RBD)中包含10多个突变。然而，对Omicron的广泛研究缺乏，需要建立相关性以通过结构比较来理解这个变异株。在这里，我们通过免疫信息学方法评估、关联和比较其基因组序列，与野生型和突变型RBD形式的刺突蛋白相结合，以了解其流行病学特征和对现有药物的反应，以更好地管理患者。我们的计算分析提供了对Omicron变异株的感染和致病途径的见解。此外，虽然分析显示南非的Omicron变异株与高传染性的B.1.620变异株相似，但突出蛋白中的突变被假设会改变其致病性。此外，对接评估显示与人受体ACE2和NRP1的结合亲和力存在显著差异。由于其使现有治疗方法失效的特性，我们通过分子对接方法评估了药物对于Omicron编码的目标蛋白的功效。大多数经过测试的药物被证明是有效的。Nirmatrelvir (Paxlovid)、MPro 13b和Lopinavir显示了增强的效果和功效，而Ivermectin对Omicron的效果最好。
作者：Md Sorwer Alam Parvez, Manash Kumar Saha, Md. Ibrahim, Yusha Araf, Md. Taufiqul Islam, Gen Ohtsuki, Mohammad Jakir Hosen
论文ID：2201.08176
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2022-05-11