连续时间概率模型的纵向电子健康记录

摘要:分析纵向电子健康记录(EHR)数据是精准医学的重要目标。将机器学习(ML)方法(无论是预测性还是无监督性)应用于EHR数据是困难的,部分原因是EHR数据的异质性和不规则采样。我们提出了一种无监督的概率模型,可以捕捉连续时间内变量之间的非线性关系。该方法适用于任意的采样模式,并捕捉变量测量和它们之间的时间间隔的联合概率分布。推理算法被推导出来,可以用来评估在训练模型下未来的可能性。作为一个例子,我们考虑了来自美国退伍军人事务管理局(VHA)的糖尿病和抑郁症领域的数据。生成了似然比图,显示了根据患者健康问卷-9(PHQ-9)测量的中度-重度与轻度抑郁症风险的可能性。

作者:Alan D. Kaplan, Uttara Tipnis, Jean C. Beckham, Nathan A. Kimbrel, David W. Oslin, Benjamin H. McMahon

论文ID:2201.03675

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2022-04-18

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