空间生长种群的家系谱分支结构及其对种群遗传学推断的影响
摘要：局部扩张模型在理解生物群落和无血管肿瘤等生长的细胞种群的人口动态和克隆大小分布方面起到了重要作用。然而，目前对由空间生长引起的合并过程的完整表征仍然缺乏，这限制了我们应用经典的人口遗传推断方法于空间生长种群的能力。在本文中，我们通过研究二维伊甸模型产生的细胞谱系的统计特性，并利用它们与有向聚合物的物理类比关系，来开始填补这一空白。我们的分析为可以通过测序轻松评估的人口测量提供了定量估计，例如分离位点的平均数和人口的克隆大小分布的子样本。我们的结果不仅揭示了生长过程中产生的谱系的显著特征，还强调了如果错误地使用非空间模型可能会被误解为选择信号的新特性。
作者：Armin Eghdami (1), Jayson Paulose (2), Diana Fusco (1) ((1) Department of Physics, University of Cambridge, (2) Department of Physics and Institute for Fundamental Science, University of Oregon)
论文ID：2112.13639
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2022-06-08