基于丹麦国家数据注册的潜在类模型对SARS-CoV-2诊断测试程序进行评估：抗原检测盒和PCR测试取样的比较
摘要：COVID-19流行期间，抗原测试工具被广泛用作筛查工具。尽管普遍认为，使用聚合酶链反应（PCR）测试进行样本分析比使用抗原测试工具能够提供更可靠的结果，但在实际环境中，这两种方法的敏感性和特异性尚未在未假设PCR测试构成金标准的情况下进行评估。我们使用潜在类别模型，利用来自丹麦国家注册的数据，估计PCR和抗原测试的原位性能。结果基于从2021年2月至2021年6月在丹麦获得的5500万次测试结果中子选出的24万次成对测试结果。我们发现，两种测试的特异性在我们的数据样本中非常高（>99.7\%），而PCR采样的敏感性估计为95.7\%（95\% CI：92.8-98.4\%），丹麦在研究期间使用的抗原测试工具的敏感性估计为53.8\%（95\% CI：49.8-57.9\%）。我们的发现可以作为实施串联测试策略时的补充信息，该策略在抗原测试工具出现阳性结果后使用确认性PCR样本，如丹麦所采用的政策。我们注意到，虽然这种策略减少了与抗原测试筛查相关的假阳性的数量，但也增加了假阴性的数量。我们证明，只有在预期真实流行率较低时，以假阳性换取假阴性的平衡才有利于串联测试的使用。由于这一时期的阳性测试结果相对较少，因此我们的结果对于敏感性估计存在较大的不确定性：因此，将我们的发现在更高流行率的人群中验证对于未来的研究非常相关。
作者：Jacob St{ae}rk-{O}stergaard, Carsten Kirkeby, Lasse Engbo Christiansen, Michael Asger Andersen, Camilla Holten M{o}ller, Marianne Voldstedlund, Matthew J. Denwood
论文ID：2112.11298
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2021-12-22