BLEND：一种快速、内存高效且准确的基因组分析中寻找模糊种子匹配的机制
摘要：基于SimHash的BLEND方法可实现通过散列值一次性查找精确匹配和高度相似种子，用于基因序列的快速相似性分析。在读取重叠和读取映射方面，BLEND方法较minimap2工具具有更高的速度和更高的准确性。
作者：Can Firtina, Jisung Park, Mohammed Alser, Jeremie S. Kim, Damla Senol Cali, Taha Shahroodi, Nika Mansouri Ghiasi, Gagandeep Singh, Konstantinos Kanellopoulos, Can Alkan, Onur Mutlu
论文ID：2112.08687
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2023-05-24