老挝蝙蝠Sarbecovirus BANAL-236通过未知机制利用ACE2感染细胞
摘要：来自老挝洞穴中发现具有与SARS-CoV-2高度序列同源性的蝙蝠沙貌病毒的手稿，可以通过人类ACE2受体直接感染人类细胞（与Indochinese半岛蝙蝠分离的具有类似SARS-CoV-2受体结合结构的冠状病毒允许ACE2介导的进入人类细胞，Temmam S.等）。在这里，我检查了其中一种病毒（BANAL-236）的基因组序列，并展示它具有非典型的5'UTR和3'UTR二级结构，实际上在传染性冠状病毒中从未见过。具体而言，5'UTR具有177个核苷酸的复制回流延伸，形成了一个扩展的、高度稳定的双链RNA结构。由于这个复制回流，当前已知所有复制中的冠状病毒中都发现了四个必需的cis-作用元件Stem Loops (SL)-1,-2,-3和-4，它们都被埋藏在扩展的双链中。3'UTR具有类似的反折双链结构，长度为144个核苷酸，并且缺少必需的多聚A尾。综上所述，这些发现表明BANAL-236缺少了八个必需的UTR cis-作用元件，每个元件在单独修改时都已被证明对复制是致命的。尽管这种双链复制回流从未在传染性沙貌病毒中观察到过，但其中一些特征在缺陷干扰颗粒中曾被观察到，这些颗粒可以在与非缺陷复制病毒的共感染中找到。它们在实验室合成基因组组装过程中也是常见的错误。BANAL-236必然进化出了一种在冠状病毒中从未见过的独特复制、RNA转录和RNA包装机制，因为它是一个与SARS-CoV-2密切相关的蝙蝠沙貌病毒，我们必须通过国际合作的研究努力来理解它独特的感染模式至关重要。
作者：Steven Carl Quay
论文ID：2112.06141
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2021-12-16