等温等压系中带电粒子的随机批次Ewald方法
摘要：精确高效可扩展的随机批处理Ewald（RBE）方法在周期性盒子中的带电粒子等温等压（NPT系）中进行模拟。通过使用适当的Lagrangian离散化得到的Langevin运动方程，RBE方法在Ewald求和的傅里叶空间中构建了mini-batch策略，从而使计算成本从$ mathcal {O}（N ^ 2）$减少到每个时间步的$ mathcal {O}（N）$。我们在LAMMPS软件包中实现了该方法，并报告了对典型系统的动态量和平衡统计量的准确模拟结果，包括全原子体积水和半各向异性膜系统。还进行了在大型超级计算集群上的数值模拟，以展示RBE的有希望的CPU效率。
作者：Jiuyang Liang and Pan Tan and Liang Hong and Shi Jin and Zhenli Xu and Lei Li
论文ID：2110.14362
分类：Computational Physics
分类简称：physics.comp-ph
提交时间：2022-10-19