关于酶反应和动力学模型的可重现性
摘要：酶反应高度依赖于反应条件。为了确保酶反应参数的重复性，需要仔细设计实验并且精确执行动力学建模。此外，为了评估酶反应参数的质量，需要全面报告实验条件、建模过程以及原始数据。通过采取这些步骤，酶反应参数可以是开放的、FAIR（可找到、可访问、可互操作、可重复使用），同时也是可重复、可确认和可重现的。本综述讨论了这些问题，并提供了一个实用指南，用于设计初始速率实验以确定酶反应参数，并给出了一个开放的、FAIR和可编辑的酶反应动力学建模示例。指南和示例都是使用Python在Jupyter Notebooks中编写的，并且公开可用（https://fairdomhub.org/investigations/483）。最后，简要讨论了自动数据分析和机器学习算法的先决条件，以进一步推动对酶反应参数进行全面、开放和FAIR的报告。
作者：Gudrun Gygli
论文ID：2110.10419
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2021-10-22