RNA的图论分割和拟结-II的分类
摘要：使用双图来建模带有伪结或交错碱基对的RNA二级结构。先前的研究中，引入了一种线性时间算法，将双图分割为最大连接的组件，称为块，并确定每个块是否包含伪结。由于伪结不能包含在两个不同的块中，这个特征允许我们高效地隔离较小的RNA片段，并将它们分类为带伪结或不带伪结的区域，同时保持这些子结构完整。此外，我们还通过将伪结分类为递归或非递归来扩展分割算法，以便在片段组装的RNA设计库研究中延续我们的研究。在本文中，我们提出了一种方法，利用我们以前的结果，并根据RNA二级结构的新颖双有向图表示，将伪结分类为经典的H、K、L和M类型。这种分类将有助于对RNA结构的系统分析和预测，例如更准确的折叠算法的实施。
作者：Louis Petingi
论文ID：2109.03236
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2021-09-09