两个铁和α-酮戊二酸依赖家族中选择酶的计算研究
摘要：DNA甲基化是真核生物中的关键表观遗传标记，然而大部分DNA甲基化可能会导致有害影响。因此，这个过程需要严密调控。AlkB和TET是依赖Fe和α-kg的超家族酶家族，负责在细胞中去甲基化DNA和RNA。这些家族的成员涵盖了所有物种，并且是转录调控的一个重要组成部分。虽然这两个家族都催化各种碱基的氧化去甲基化，但每个家族对甲基化碱基的偏好以及不同的催化机制都有特定的偏好。这个观点旨在为研究AlkB、ALKBH2、ALKBH3和TET2等这些酶家族的几个成员的计算工作提供一幅概述。结构细节、突变研究、反应路径分析、活性位点的电子结构特征以及底物偏好等见解被展示和讨论。
作者：Madison B. Berger, Alice R. Walker, Erik Antonio V''azquez Montelongo and G. Andr''es Cisneros
论文ID：2108.10959
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2021-11-03