IBEX：一种用于多样组织的高内容多重成像的开放可扩展方法
摘要：高度内容的成像技术对于分类介绍多细胞生态系统和来自多细胞生态系统的多样性细胞表型至关重要。我们最近开发了一种名为IBEX的多次漂白扩展技术，该技术采用迭代免疫标记和化学漂白方法，在包括与国际合作组织相关的人体器官在内的不同组织中实现了多重成像（超过65个参数）。IBEX兼容于超过250种商业抗体、16种独特荧光染料，可以通过切片和非专有成像仓进行不同成像平台上的容易采用。总体方案包括抗体标记、成像和化学漂白三个迭代周期，通过基本实验室技能的生物学家在较低成本下可在2-5天内完成。为了支持广泛应用，我们提供了关于组织处理的详细信息、经过验证的抗体筛选清单，以及用于多重成像的组织特异性面板。此外，还提供了如何使用价格相对较低的仪器和试剂来自动化该方法的说明。最后，我们提供了一种图像对齐的软件解决方案，普通人可以使用开源软件和免费软件进行操作，无需编程经验。总之，IBEX是一种开放且多功能的方法，可以很容易地由学术实验室采用，并能够扩大规模，以实现对多样组织进行高内容的映射，以支持人类参考图谱或其他类似应用。
作者：Andrea J. Radtke, Colin J. Chu, Ziv Yaniv, Li Yao, James Marr, Rebecca T. Beuschel, Hiroshi Ichise, Anita Gola, Juraj Kabat, Bradley Lowekamp, Emily Speranza, Joshua Croteau, Nishant Thakur, Danny Jonigk, Jeremy Davis, Jonathan M. Hernandez, and Ronald N. Germain
论文ID：2107.11364
分类：Tissues and Organs
分类简称：q-bio.TO
提交时间：2021-07-26