FANCA：早期白血病预测的体外有害突变分析
摘要：FANCA基因在Fanconi贫血互补组（FANC）家族中是一种新的生物标记物，与白血病癌症相关。FANCA的过表达已预示着世界上第二常见的癌症，负责癌症相关死亡。非同义单核苷酸多态性（nsSNP）是一组导致编码多肽改变的SNP。基因产物氨基酸序列的改变导致了白血病。首先，我们研究了FANCA编码区的个体SNPs，并使用PROVEAN、PolyPhen2、MuPro和PANTHER等计算工具计算有害突变分数。使用I-TASSER进行了三维结构和功能预测。进一步，使用GlaxyWeb工具对预测的结构进行了改进。在研究中，使用UniProtKB中检索到的蛋白质组学数据。数据集的编码区包含100个非同义单核苷酸多态性（nsSNPs），其中24个错义SNPs经过所有分析被确定为有害突变。在这项工作中，使用了六种知名的计算工具研究了与白血病相关的nsSNPs。推测这些nsSNPs可能在FANCA上调中发挥作用，进一步促进白血病的进展。当前研究将有助于处理与FANCA相关的癌症相关疾病的研究人员和从业者。拟议的研究还将有助于在药物发现领域开发精准医学。
作者：Madiha Hameed, Abdul Majiid, Asifullah Khan
论文ID：2107.09056
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2021-11-01