Sramm: 短读对齐映射度量
摘要：短序列比对映射评估指标（SRAMM）：是一种高效而多功能的命令行工具，提供额外的短序列比对评估指标、过滤和图形化功能。短序列比对工具报告映射质量（MAPQ），但这些方法通常在文献或软件手册中没有标准化或详细描述。此外，第三方的映射质量程序通常计算密集或设计用于特定应用。SRAMM高效地生成多种不同的基于概念的比对评分，以为下游应用的比对后检查和过滤过程提供信息。SRAMM兼容Python 2.6+和Python 3.6+，适用于所有操作系统。它可以与生成SAM/BAM/CRAM文件输出并报告“AS”标签的任何短序列比对工具一起使用。在MIT许可下免费提供，网址为http://github.com/achon/sramm。
作者：Alvin Chon, Xiaoqiu Huang
论文ID：2107.02935
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2021-07-08