自组装过程的单单体测量分析工具
摘要：蛋白质组装在生命的所有物种中起着重要作用，无论是在生理学上还是在病理学上。特别是蛋白质的聚集和聚合是调节细胞功能的关键策略。近年来，已经开发出了能够在单分子水平上研究组装过程的实验方法。这一进展同时引发了如何充分分析这种类型的单丝数据以及实验条件中需要什么样的条件来进行有意义的解释的问题。在这里，我们开发了两种分析单丝数据的方法：访问分析和平均速率分析。我们用经常用于研究微观结合和解离速率的经典停留时间分析方法对这两种方法进行了基准测试和比较。特别地，我们测试了每种分析方法在信噪比、采样速率以及用于单分子荧光实验中使用的荧光染料的标记效率和褪色速率方面的局限性。最后，我们将我们新开发的方法应用于在Cappuccino II类核化剂和Spire的WH2重复序列存在下，研究了肌动蛋白单倍体组装的单分子水平。对于Cappuccino的实验数据表明，快速伸长绕过一个核化阶段，而对于Spire，我们发现四个WH2模体不足以促进肌动蛋白的新生核化。
作者：Maria Hoyer, Alvaro H. Crevenna, Radoslaw Kitel, Kherim Willems, Miroslawa Czub, Grzegorz Dubin, Pol Van Dorpe, Tad A. Holak and Don C. Lamb
论文ID：2106.13625
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2021-06-28