ciftiTools：用于在R中读取、写入、可视化和操作CIFTI文件的软件包
摘要：使用表面和灰质分析磁共振数据具有显著的兴趣，原因包括改善整个皮层的可视化，能够进行表面平滑以避免与体积平滑相关的问题，改善受试者间的对齐以及降低维度。人类连接计划引入的CIFTI灰度坐标文件格式将左右皮层半球的灰质数据与次皮层和小脑的灰质数据合并成一个文件，进一步推进了基于灰度坐标的分析。在灰度坐标空间中进行的分析非常适合通过传统分析技术和更先进的统计方法（包括贝叶斯方法）利用跨大脑和受试者之间共享的信息。R统计环境便于使用高级统计技术，但以前在R中几乎没有针对灰度坐标分析的支持。实际上，在任何语言中，几乎没有可以用来处理CIFTI文件的全面的编程工具。在这里，我们介绍了ciftiTools R软件包，它提供了一个统一的环境来读取、写入、可视化和操作CIFTI文件和相关数据格式。我们介绍了ciftiTools在R中方便和用户友好的工具套件，用于处理灰度坐标和表面几何数据，并描述了如何利用ciftiTools推进基于灰度坐标的功能性磁共振数据的统计分析。
作者：Damon Pham, John Muschelli, Amanda Mejia
论文ID：2106.11338
分类：Computation
分类简称：stat.CO
提交时间：2022-05-04