CoV-Spectrum：分析全球共享的SARS-CoV-2数据以识别和描述新变异体
摘要：CoV-Spectrum网站支持确认新的SARS-CoV-2关注变异体的识别和已知变异体的跟踪。其灵活的氨基酸和核苷酸突变搜索允许在它们被谱系命名系统指定之前进行查询。该平台汇集了来自不同来源的SARS-CoV-2数据并应用了分析。结果包括不同变异体随时间的比例、它们的人口统计和地理分布、常见突变、住院和死亡概率、传播适应性优势的估计以及从废水样本中获得的见解。 可用性和实施: CoV-Spectrum网站可在https://cov-spectrum.ethz.ch上获得。代码在https://github.com/cevo-public/cov-spectrum-website上以GPL-3.0许可证发布。
作者：Chaoran Chen, Sarah Nadeau, Michael Yared, Philippe Voinov, Ning Xie, Cornelius Roemer, Tanja Stadler
论文ID：2106.08106
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2021-12-28