一种具有自适应弹簧长度的改进推动弹性带算法
摘要:改进的弹性带(NEB)算法来寻找连接两个已知构型的最小能量路径。我们展示了用Onsager-Machlup动作的离散化版本取代谐波带能量项,得到一种具有自适应弹簧长度的NEB算法,该算法可以自动增加潜能面鞍点附近最小能量路径的分辨率。该方法在每个优化步骤中具有与标准NEB算法相同的计算成本,并且不引入额外的参数。我们将其应用于丙氨酸二肽的异构化、乙烷脱氢和石墨烯中的5-77-5缺陷修复。
作者:Davide Mandelli, Michele Parrinello
论文ID:2106.06275
分类:Computational Physics
分类简称:physics.comp-ph
提交时间:2021-08-16