3D脑显微镜的基本元数据
摘要：大脑组织的清晰化、标记和染色等荧光显微镜技术的最新进展为研究大脑结构和功能提供了前所未有的机会。这些实验图像使得在天然环境中编目大脑细胞类型，并确定它们的位置、形态和连接成为可能，从而更好地理解正常发育和疾病病因。一致的元数据注释是必要的，以提供理解、重用和整合这些数据所需的上下文。本文描述了为大脑研究通过推进创新性神经技术（BRAIN）计划和神经科学研究共同体建立3D显微镜数据集的元数据标准的努力。这些标准基于现有的工作，并结合了大脑显微镜共同体的意见，以促进采用。最终形成的 Essential Metadata for 3D BRAIN Microscopy 包括91个字段，分为七个类别：Contributors、Funders、Publication、Instrument、Dataset、Specimen和Image。采用这些元数据标准将确保调查人员得到他们工作的认可，促进数据重用，便于共享数据的下游分析，并鼓励合作。
作者：Alexander J. Ropelewski, Megan A. Rizzo, Jason R. Swedlow, Jan Huisken, Pavel Osten, Neda Khanjani, Kurt Weiss, Vesselina Bakalov, Michelle Engle, Lauren Gridley, Michelle Krzyzanowski, Tom Madden, Deborah Maiese, Justin Waterfield, David Williams, Carol Hamilton, and Wayne Huggins
论文ID：2105.09158
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2021-05-20