生物鲁棒性属性的形式化描述与高效验证

摘要:鲁棒性是一种可观察的属性,化学反应网络能够在受到不同扰动的影响下保持其功能。通常,为了验证网络的鲁棒性,需要考虑所有可能的参数配置。这是一个可能需要大量计算工作的过程。在Rizk等人的工作中,作者们通过线性时间逻辑(LTL)提出了鲁棒性的定义,通过考虑不同参数配置下获得的多个数值时序跟踪,验证了反应网络的鲁棒性。在本文中,我们专注于一种初始浓度鲁棒性(α-鲁棒性)的概念,该概念与一种物种的初始浓度(输入)对另一种物种的浓度(输出)在稳态时的影响有关。我们在Rizk等人提出的框架中对这种鲁棒性概念进行了描述,并且我们证明,在单调反应网络中,这可以大大减少验证反应网络鲁棒性所需的跟踪数量。

作者:Lucia Nasti, Roberta Gori, Paolo Milazzo

论文ID:2104.13831

分类:Formal Languages and Automata Theory

分类简称:cs.FL

提交时间:2021-04-29

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