HSMA：一种在LAMMPS中实现的O(N)电静力学软件包
摘要：向LAMMPS分子动力学模拟引擎中实现了两种最近开发的快速库仑求解器HSMA3D[J. Chem. Phys. 149 (8) (2018) 084111]和HSMA2D[J. Chem. Phys. 152 (13) (2020) 134109] 的用户包HSMA。 HSMA包是为了在O(N)成本下高效准确建模具有介电效应的3D和2D周期系统的静电相互作用而设计的。实现是混合MPI和OpenMP并行化的，并且与现有的LAMMPS功能兼容。采用AVX512指令的向量化技术进行加速。为了证实我们的实现的有效性，我们与在LAMMPS和其他介电求解器中广泛使用的粒子-粒子粒子-网格（PPPM）算法进行了广泛的比较。通过正确选择算法参数和并行化设置，该包能够在广泛的粒子数范围内在速度上超越标准的PPPM，计算静电相互作用。
作者：Jiuyang Liang, Jiaxing Yuan, Zhenli Xu
论文ID：2104.05260
分类：Computational Physics
分类简称：physics.comp-ph
提交时间：2022-05-18