ExpressInHost: 一种用于宿主微生物中重组蛋白表达的密码子调控工具
摘要：ExpressInHost：一种基于GTK/C++的用户友好的图形界面，用于在宿主微生物中调整mRNA的密码子序列以用于重组蛋白表达。异源基因表达在生物技术公司和学术研究实验室中被广泛应用。然而，重组蛋白表达可能具有挑战性。一方面，在与生物技术公司有关的可扩展生产过程中，最大化翻译速度非常重要，但另一方面，由于翻译"暂停"可能是允许新生聚肽链适当折叠的关键，因此往往会出现溶解性问题。为了解决这个挑战，我们开发了一款软件，提供了三种不同的模式来利用遗传密码的冗余性来调整密码子序列。所实施的调整策略考虑了宿主和原生生物的特定tRNA资源。它们在快速翻译和模拟原生速度之间取得平衡，这对于允许适当蛋白折叠可能很重要，从而避免蛋白溶解性问题。
作者：Ad''ela"ideRaguin, Ian Stansfield, and Maria Carmen Romano
论文ID：2103.08365
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2022-11-01