疏水相互作用决定了SARS CoV-2变异体与抗体的对接亲和力
摘要：新型冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 变异体的传播能力增强，同时降低了已有疫苗的效力。研究发现，尖突蛋白中受体结合区 (RBD) 的四种突变被认为有助于增加传播能力。理解SARS-CoV-2变异株与ACE2之间亲和力增强的物理机制是开发针对冠状病毒病2019 (COVID-19) 大流行的阻断剂、疫苗和治疗抗体的"紧急挑战"。本研究基于一个基于疏水相互作用的蛋白质对接机制，揭示了突变体N501Y明显增加了RBD和ACE2之间的疏水吸引力，减少了亲水排斥力，这很可能导致变异体的传播增加。通过分析SARS-CoV-2变异株和抗体的复合物结合位点中突变引起的疏水表面变化，我们发现突变体N501Y、E484K、K417N和L452R都可以选择性地减少或增加与某些抗体的结合亲和力。
作者：Jiacheng Li, Chengyu Hou, Menghao Wang, Chencheng Liao, Shuai Guo, Liping Shi, Xiaoliang Ma, Hongchi Zhang, Shenda Jiang, Bing Zheng, Lin Ye, Lin Yang, Xiaodong He
论文ID：2103.00399
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2021-03-02