α-突触核蛋白的构象偏好及瞬时结节形成

摘要:通过使用含显式和隐式溶剂的全原子模拟,我们研究了α-突触素动力学中的局部构象偏好。这些偏好与特定接触形成的频率相关。在两种方法中,蛋白质本身是无序的,其最强的偏好是形成弯曲和转折的局部结构。显式溶剂构象可以更加伸展,这可以使暂时的三叶结成型(无论是深的还是浅的)可以持续长达5微秒。两链自组装事件(无论是短暂还是长时间存在)的主要成分是在序列的中部形成接触。当与胶束结合时,这部分序列倾向于形成螺旋。

作者:Mateusz Chwastyk, Marek Cieplak

论文ID:2102.03682

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2021-02-09

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