杂交倍性剖面的混合数
摘要：多倍化是一种重要的进化事件，即生物从父代继承多个基因组的副本，已在植物和动物中观察到。研究这种事件的一种方法是根据构成感兴趣数据集的物种的倍数数量来研究。因此，自然而然地会问：从物种的倍数数量中能够获得关于数据集形成物种的进化历史的多少信息？为了帮助回答这个问题，我们引入和研究了一种新概念，即倍数配置文件，它允许我们用由数据集组成的物种索引的多样向量形式进行形式化。利用系统发育网络的框架，我们提出了一个计算一类大规模倍性配置文件的杂交数（即解释倍性配置文件所需的最小多倍化事件数量）的闭合公式。该公式依赖于通过简化倍性配置文件的简化序列和初始设置该构造的倍性配置文件的杂交数的系统发育网络的构建。在倍性配置文件的倍数数量不太大的情况下，两者都可以很容易地计算。为了帮助说明我们方法的适用性，我们将其应用于一个简化版本的公开可用的金莲花数据集。
作者：Katharina T. Huber and Liam J. Maher
论文ID：2101.10746
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2022-08-12