执行和基准测试单细胞RNA测序数据分析中八种计算双子检测方法的协议
摘要：单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析中存在双体的存在是一个重要的混杂因素。已经开发了计算方法来从scRNA-seq数据中检测双体。我们开发了一个R软件包DoubletCollection，用于整合八种双体检测方法的安装和执行。DoubletCollection还提供了一个统一的界面，用于在双体检测之后进行下游分析和可视化。在这里，我们提出了使用DoubletCollection评估双体检测方法的一个方案。这个方案可以自动适应快速发展的scRNA-seq领域中的新的双体检测方法。
作者：Nan Miles Xi and Jingyi Jessica Li
论文ID：2101.08860
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2021-12-01