人体蛋白酶被共价配体抑制的原子模拟
摘要：蛋白酶体在蛋白质降解中起着重要作用，因此受到广泛研究。最近的X射线晶体学和冷冻电镜数据表明，抑制剂的结合会引起蛋白酶体发生大规模的结构变化。我们进行了原子级分子动力学模拟，以了解抑制剂对蛋白酶体的分子细节的影响。在这里，我们描述了模拟的技术细节，并评估了所获得轨迹的质量。蛋白酶体的生物化学方面正在进一步研究，并将在其他地方发表。该工作是在HLRS的GCS-Prot项目中进行的，使用Cray XC40超级计算系统运行。
作者：Michal H. Kol''av{r} and Lars V. Bock and Helmut Grubm"uller
论文ID：2012.03387
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2020-12-08