蝙蝠冠状病毒RmYN02在S1/S2连接处具有6核苷酸缺失，其声称的PAA插入高度可疑。
摘要：RmYN02与SARS-CoV-2密切相关，据称其在刺突蛋白的S1/S2连接处包含自然发生的PAA氨基酸插入，在与SARS-CoV-2中创建了多基性furin剪切位点的PRRA插入处的相同位置。作者支持他们的发现，即SARS-CoV-2中的furin剪切位点插入是自然的。因为Zhou等人没有提供与编码插入位置的假定插入物的相关区域紧密相关的菌株的核苷酸比对，所以我们应用了多个比对算法来查找最简洁的比对。我们得出结论，与核苷酸水平上最接近的亲属相比，RmYN02在S1/S2连接处并没有插入物，而是存在6个核苷酸的缺失，并且所声称的PAA插入更有可能是突变的结果。对RmYN02测序记录和组装方法的仔细检查是值得的。总之，SARS-CoV-2在S1/S2连接处的12个核苷酸插入物仍然是其sarbecovirus亲属中的独特存在。
作者：Yuri Deigin (1) and Rossana Segreto (2) ((1) Youthereum Genetics Inc., Toronto, ON Canada, (2) Department of Microbiology, University of Innsbruck, Austria)
论文ID：2012.00627
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2020-12-02