计算机重新用途的药物和天然产物作为潜在的COVID-19疗法对抗RNA依赖性RNA聚合酶
摘要：使用已经注册或已经通过人类试验评估安全性的药物（离标使用）或已批准的天然产品来快速开发COVID-19是可行的。这些药物可以快速评估COVID-19患者的安全性和药代动力学，因为它们的安全性和药代动力学已经很好地了解。计算方法可以通过预测和排名这些化合物与特定病毒蛋白靶点的亲和力，快速筛选出具有潜在SARS-CoV-2活性的产品。基于RdRP的RNA依赖性RNA聚合酶是SARS-CoV-2药物研发的有希望的靶点，因为它没有人类同源物，使RdRP抑制剂可能更安全，副作用更少。我们将RdRP上的强大的Vina对接方法与分子动力学（MD）模拟相结合，对排名前80个已找到的候选药物进行筛选，得到了最有希望的RdRP抑制剂列表。文献回顾表明，许多预测的抑制剂已经在体外试验中显示出活性，或者被其他研究组预测具有活性。我们筛选出的新型药物可以方便地在RdRP抑制测定中测试其活性，如果证实在体外抗病毒活性测试后，再进行人体试验。
作者：Sakshi Piplani, Puneet Singh, David A. Winkler, Nikolai Petrovsky
论文ID：2011.14241
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-12-01