开源脉冲多区域猴子皮层模型的使用和扩展
摘要：进入“大规模”计算神经科学的时代，神经网络模型的规模和底层数据集的数量不断增加。将各种模型整合到与广泛数据一致的大规模模型中，只有大团队的努力才有可能实现，这些团队可以分布在多个研究机构中。为了确保计算神经科学家能够建立在彼此的工作基础上，重要的是将模型作为文档完善的代码公开。本章介绍了这样一个开源模型，它将猴子的所有与视觉相关的皮层区域的连接结构与它们的静息状态动力学联系起来。我们简要介绍了如何使用可执行的模型规范，该规范使用NEST作为仿真引擎，并展示了其运行时间的扩展性。所找到的解决方案作为未来模型从原始实验数据到结果可视化的工作流的示例，揭示了挑战，并为神经科学的ICT基础设施建设提供了指导。
作者：Sacha Jennifer van Albada, Jari Pronold, Alexander van Meegen, Markus Diesmann
论文ID：2011.11335
分类：Neurons and Cognition
分类简称：q-bio.NC
提交时间：2022-10-17