天然多酚类物质福尔妮林及其结构类似物是SARS-CoV-2主要蛋白酶二聚化的抑制剂：分子模拟研究揭示
摘要：3CL-Pro蛋白酶（或M-Pro）是SARS-CoV-2的主要蛋白酶，作为同源二聚体，负责对大型聚合蛋白1ab转录物进行裂解，以影响病毒的生长和复制。3CL-Pro一直是最受关注的SARS-CoV-2蛋白之一，也是治疗干预的研究对象，针对其催化结构域进行靶向治疗。已经报道了一些药物候选物，包括一些天然产物。本研究通过结合和分子动力学模拟，对天然产物空间进行了体外研究，以寻找3CL-Pro二聚抑制剂的候选物。我们发现天然黄酮苷类化合物fortunellin（乙基芹菜素7-O-新橙皮苷）是3CL-Pro二聚化抑制剂的有效抑制剂。对ZINC天然产物数据库进行搜索发现还有另外16种相关分子，包括apilin和rhoifolin，具有有趣的药理特性。我们认为fortunellin及其结构类似物可能成为新型药物和膳食补充剂，用于对抗SARS-CoV-2引起的COVID-19疾病。
作者：Athanasios A. Panagiotopoulos, Danai-Maria Kotzampasi, George Sourvinos, Marilena Kampa, Stergios Pirintsos, Elias Castanas, Vangelis Daskalakis
论文ID：2007.07736
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-09-17