极限基因组的近全蛋白质结构建模
摘要：蛋白质三级结构预测在近年来有了很大的改进。在没有结构模板的情况下，可以对多种蛋白质组进行建模。我们的DMPfold方法能否模拟JCVI-syn3.0最小基因组中没有模板的所有蛋白质呢，其中包含了438个蛋白质。我们发现，对于除10个蛋白质之外的所有蛋白质，都可以提供有用的三级结构注释。这些模型可以帮助注释未知的功能，并提供了29个预测的蛋白质相互作用的覆盖范围，这些相互作用缺乏单体模型。我们还展示了DMPfold对自初始出版以来已发布的蛋白质结构的良好预测能力。预计在未来几年内，最小基因组的结构覆盖将会完整。
作者：Joe G Greener, Nikita Desai, Shaun M Kandathil, David T Jones
论文ID：2007.06623
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-07-15