基于计算模拟的ADMET和分子对接研究：从柠檬类苷和三萜类化合物中寻找COVID-19潜在抑制剂
摘要：通过分子对接、模拟、in silico ADMET和药物相似性预测，对植物化合物进行虚拟筛选，以发现能够抑制SARS-CoV-2效应的潜在靶点。考虑到有关药用重要性的已发表文献，从柠檬苦苷和三萜类化合物中选择了154个具有类似结构的植物化合物，以寻找SARS-CoV-2的五个治疗蛋白靶点的潜在抑制剂，即3CLpro（主蛋白酶）、PLpro（类木瓜酶样蛋白酶）、SGp-RBD（尖峰糖蛋白-受体结合结构域）、RdRp（RNA依赖性RNA聚合酶）和ACE2（血管紧张素转化酶2）。in silico计算结果显示，甘草酸、柠檬酸、7-脱乙酰基-7-苯甲酰基吉贝酮、橄榄酸、角叉酸、橄榄萜醇酸和熊果酸等植物化合物对SARS-CoV-2的靶蛋白具有有效抗作用。蛋白质-配体相互作用研究显示，这些植物化合物与靶蛋白的活性位点上的氨基酸残基结合。因此，这些潜在抑制剂的核心结构可用于进一步的引物优化，设计SARS-CoV-2药物。此外，含有这些植物化合物的药用植物，如甘草、苦楝、罗勒、柑橘和橄榄，可以用于制定适合的传统药物治疗方法。
作者：Seshu Vardhan and Suban K Sahoo
论文ID：2005.07955
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-07-30