环扩张的有效模型预测染色体域

摘要:主动环转移机制被视为负责染色体长程序域结构的主要非平衡机制。我们开发了一个模型来研究染色体纤维的动力学,通过求解与环转移物体运动相关的动力学方程。通过将链上的环转移物体位置平均化,我们构建一个能够仅基于环转移阻断蛋白的位置重现实验接触图的有效平衡模型。我们通过对染色体片段进行数值模拟,并将结果与显式环转移模型和实验数据进行比较,评估了有效模型的质量。

作者:M. Crippa, Y. Zhan, G. Tiana

论文ID:2005.07108

分类:Biomolecules

分类简称:q-bio.BM

提交时间:2020-09-30

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