高保真表观遗传：信息论模型预测复制后组蛋白修饰的$k$阈值填充
摘要：基因组法则之外，还有另一层信息通过位于DNA上的组蛋白蛋白质的化学修饰来编码。保持这些修饰对于细胞的生存和身份至关重要。然而，考虑到每个母体核小体只传递给每个女儿染色质的一半，有关组蛋白标记所编码的信息如何继承的问题仍然困扰着我们。本研究借鉴信息论的思想和最近生物实验的理解来解决这个问题。通过将修饰的复制和重构映射到通信中的等效问题，我们问的是，如果酶机制是理想的计算机，它们能够恢复多少信息。在能够实际运作的酶机制参数范围内，我们的分析预测，实际上酶可能实施一个恢复算法，该算法源自最大后验概率解码。使用我们的方法进行的模拟产生了与最近实验所观察到的修饰模式类似的结果。
作者：Nithya Ramakrishnan, Sibi Raj B Pillai, Ranjith Padinhateeri
论文ID：2005.06539
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2020-05-15