选定的人畜共患冠状病毒的S基因区域的体外核苷酸和蛋白质分析揭示了保守结构域以及从SARS-CoV2基因组数据中进化出的病毒入侵的演化轨迹
摘要：新型冠状病毒（COVID-19）最近的人兽共患病毒爆发迫使我们充分了解人兽共患病毒的进化路径，以便在现在和将来对抗大流行病的治疗构建中适当应对。我们分析了严重急性呼吸系统冠状病毒2（SARS-CoV-2）的保守域，以寻找宿主细胞中可能的病毒入侵抑制靶点，以及人类冠状病毒（229E）和与SARS-CoV-2有关的人兽共患冠状病毒之间以及选择的SARS-CoV-2基因组数据之间的进化关系。在SARS-CoV-2中对宿主天然抗病毒细胞机制产生拮抗作用的保守域包括nsp 11、nsp 13等。此外，对选定的候选人兽共患冠状病毒的尖峰（S）基因蛋白进行多序列比对，并与SARS-CoV-2的S基因蛋白进行比较，显示出与穿山甲冠状病毒的S基因最密切的进化关系（95.6％）。武汉SARS-CoV-2的系统发育数据和其他五个系统发育数据形成类群，揭示了病毒入侵的轨迹，同时还揭示了菲律宾的SARS-CoV-2基因组和蛋白数据作为早期祖先。因此，SARS-CoV-2基因组数据的系统发育表明了在现有和未来的人兽共患冠状病毒爆发中进行不同人群的分类，同时考虑迁移历史和种族背景，以便追踪突变并确定病毒亚型分歧的日期，这对于有效管理现有和未来的人兽共患冠状病毒爆发至关重要。
作者：Adejoke Olukayode Obajuluwa, Pius Abimbola Okiki, Tiwalola Madoc Obajuluwa, Olakunle Bamikole Afolabi
论文ID：2005.02809
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2020-05-07