选定的FDA批准药物与COVID-19关键蛋白靶点的分子对接和结合模式分析：寻找应对COVID-19的药物再利用的组合治疗方法
摘要：COVID-19疫情的出现严重影响了抗病毒和抗生素药物的选择。药物发现是一个多步骤的过程，失败率高、成本高，并且新药物的发展需要大约10-12年的时间。另一方面，药物重复利用，也被称为将旧药物用于新用途，是一种有吸引力的替代方法，用于市场上已获得FDA批准的或正在研究的药物的新应用。在当前由COVID-19引发的流行病情况下，重复使用已获得FDA批准的药物正在成为治疗的首选。这种高度传染性疾病和急性呼吸道综合征冠状病毒（SARS-CoV）的致病病毒在核苷酸上具有高度相似性。因此，许多现有的病毒靶点在结构上预计与SARS-CoV相似，并有可能被相同的化合物抑制。在这里，我们选择了三种病毒关键蛋白，根据它们在病毒生命周期中的关键作用：ACE2（用于进入人体宿主），病毒非结构蛋白RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）NSP12和NSP16（帮助复制和病毒潜伏以逃避免疫）。 FDA批准的药物氯喹（CQ），羟氯喹（HCQ），雷德西韦（RDV）和阿比朵尔（ABD）正在成为抗击COVID-19的有希望的药物。我们在进行对接研究时的假设是确定这些药物的结合亲和力，并确定在其作用机制中起关键作用的关键氨基酸残基。对接研究是通过Autodock和在线COVID-19对接服务器进行的。需要进一步研究广泛范围的FDA批准的药物，包括几个其他蛋白靶点，分子动力学研究，体外和体内生物学评估，以确定针对病毒生命周期的各个阶段的联合治疗。
作者：Atanu Barik, Geeta Rai, Gyan Modi
论文ID：2004.06447
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-04-15