印度SARS-CoV-2刺突蛋白1与ACE2的建模和对接：对共病和治疗干预的意义
摘要：印度目前承担着非传染性疾病（如糖尿病、高血压和心血管疾病）的最高负担，并因此成为SARS-CoV-2/COVID-19大流行的易感目标。目前，血管紧张素转换酶2（ACE2）在SARS-CoV-2感染和病理发生中的作用是一个正在积极研究的领域。糖尿病、高血压和心血管疾病患者对感染的易感性增加，以及这些情况下循环ACE2水平的增高，使得与可溶性ACE2的相互作用可能导致病毒受体复合物的广泛扩散，从而增强病毒的获取和病理发生。因此，理解SARS-CoV-2受体结合域-ACE2相互作用，无论是膜结合还是在细胞自由环境中，可能有助于阐明共病对感染易感性和病理发生的作用。阿奇霉素和羟氯喹（HCQ）都显示出在感染者中减轻病毒携带的有效性。此外，这些化合物各自产生活性代谢物，这些代谢物反过来可能也调节病毒受体的相互作用，从而影响临床结果。在这项研究中，我们模拟了S1与全长和可溶性ACE2的结构相互作用。此外，治疗药物及其活性代谢物与可溶性ACE2蛋白的结合进行了对接。我们的结果表明，报告的印度序列中的任何一个S1都能与全长和可溶性ACE2结合，尽管亲和力各不相同，这可以归因于RBD中报告的一个置换。此外，阿奇霉素和羟氯喹以及它们的活性代谢物都可以对ACE2和S1的结合产生变异的影响。
作者：Dhanashree Jagtap, Selvaa Kumar C, Smita Mahale, Vainav Patel
论文ID：2004.06361
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2020-04-15