比较SARS-CoV-2和SARS-CoV受体结合域中的结合相互作用
摘要：COVID-19病毒与SARS-CoV-1病毒相比，突刺蛋白的突变导致其对ACE2人体细胞受体具有更高的亲和力。通过分子动力学模拟和Monte Carlo采样，我们发现SARS-CoV-2与ACE2的结合亲和力比SARS-CoV增强了7 kcal/mol，这是由于电荷静电相互作用的加强。电荷静电相互作用造成的结合能主要来源于SARS-CoV的R426与ACE2的E329之间的盐桥以及SARS-CoV-2的K417与ACE2的D30之间的盐桥。此外，单个突变对结合能的贡献并不显著，但这些突变引起了复杂的结构变化，增强了结合能。我们的结果还表明，SARS-CoV-2不太可能是实验室制造的病毒。
作者：Muhamed Amin, Mariam K. Sorour, Amal Kasry
论文ID：2004.02158
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2020-04-07